D'un point de vue étiologique on classe les dyspepsies en trois catégories : les dyspepsies organiques, les dyspepsies fonctionnelles avec anomalie associée et les dyspepsies fonctionnelles sans anomalie objectivable par des examens de pratique courante. Drossman et coll. ont subdivisé cliniquement la dyspepsie en 4 sous-types : 1) dyspepsie de type ulcéreux qui associe deux ou plus des signes suivants, douleurs soulagées par les aliments ou les antiacides, douleurs périodiques, douleurs postprandiales, douleurs réveillant le malade la nuit, 2) dyspepsie de type moteur qui associe outre une douleur ou une gène épigastrique, deux ou plus des signes suivants : nausées et/ou vomissements, anorexie, ballonnement postprandial, et/ou impression de plénitude gastrique, éructation excessive, 3) dyspepsie de type reflux gastro-œsophagien qui associe gênes ou douleurs épigastriques et un pyrosis ou des régurgitations, 4) dyspepsie inclassée ou non spécifique.